傳統(tǒng)微生物組研究借助多種測序技術(shù)，從多維度解析微生物群落特征。宏基因組測序分析提取樣品中微生物群落總基因組 DNA，構(gòu)建文庫后高通量測序并分析，可研究微生物種群結(jié)構(gòu)、基因功能活性、微生物間及微生物與環(huán)境間關(guān)系；去宿主宏基因組測序針對宿主污染多、微生物含量低的樣本，去除宿主 DNA 后測序，提高微生物 reads 占比，助力宏基因組組裝與深入研究；宏轉(zhuǎn)錄組測序提取微生物群體總 RNA，去除 rRNA 構(gòu)建文庫測序，從轉(zhuǎn)錄水平探究微生物群落變化與功能活性基因；真菌組測序則對宏基因組樣本中的真菌富集后提取 DNA 測序，分析真菌序列、豐度、功能、多樣性、致病性及與其他生物的互作關(guān)系。