二代及三代測序得到的豐度數據都是從原始測序數據均一化之后得到的相對豐度，即一百萬條序列中物種的比例，也就是我們所說的相對定量（RMP），然而真實世界中的環境比較復雜，微生物的總量很難像基因表達一樣可以在同一總量下進行比較，并且微生物的負荷對宿主的影響非常關鍵。在微生物組研究中只用相對豐度進行比較研究就會受到極大限制，所以絕對定量（QMP）在微生物組學研究中就顯得極為關鍵，這也是為什么近年來眾多科學家提出需要開展絕對定量研究的原因。