常見問題
病毒組常見問題
使用核酸檢測采樣管采集的樣本可以做病毒組嗎?
能。但不能再做病毒富集。核酸檢測采樣管通常包含病毒滅活試劑,滅活后病毒裂解,無法再進行病毒顆粒的富集。即使是非滅活的病毒采樣管,也無法確定其中的成分是否會影響后續實驗,因此不推薦使用。
特殊樣本,客戶可以定制病毒分離方法嗎?
可以。我們實驗室可以根據客戶樣本情況設計優化實驗方。
病毒組研究中,需要同時進行宏基因組或者16S關聯分析,基因幫能提供嗎?
可以。我們提供全套實驗和分析解決方案,根據研究方案可以分離提取宏基因組和病毒組核酸,分別進行宏基因組建庫和病毒組建庫,并測序分析。
病毒組測序分析完成后,需要進行后續的驗證服務,基因幫能提供嗎?
可以。基因幫會根據項目設計和實驗室的通量確定,不保證所有項目都能提供后續服務,這部分服務會另收費。
珍稀樣本如何降低實驗風險?
珍稀樣本建議盡可能保存備份,避免反復凍融。我們在收到樣品后,會先選取樣本量較大的樣品,取部分樣品進行預實驗,然后根據預實驗的結果確定最優的實驗條件。在此基礎上對其他樣本進行病毒組核酸提取和建庫。同時我們在條件允許的情況下,也會盡可能保留備份,保證每個樣品都能獲得可靠的病毒組數據。
一般病毒組的相關研究每一組需要多少樣本合適?
樣本數根據樣本收取的難易程度不同而不同,樣本數量越多越能降低個體差異對后續分析的影響。通常來說每組樣品30-50例能夠滿足普通的研究需要。對于某些特殊項目,一般來說最少也不能低于每組10個樣品。
關注某一個病毒,但是無法從宿主體內分離培養,可以通過病毒組測序技術獲得該病毒的基因組序列嗎?
病毒組測序最大的優勢就在于無需通過傳統的病毒培養即可獲得樣品中的病毒核酸序列。尤其對于樣品中豐度較高的病毒或者在宿主中活躍復制的病毒,我們很可能通過病毒組測序獲得其全長基因組序列。
病毒組樣本保存有什么特別需要注意的地方嗎?
病毒組樣本采集和保存與宏基因組不同,我們不建議采用任何商售的核酸保護液保存樣品。建議拭子樣品置于400-600μl PBS或生理鹽水中,并凍存于- 80 ℃冰箱 ,組織樣品無需加保護劑,清理干凈后直接凍于- 80℃冰箱即可。
樣本郵寄需要什么保存條件?常溫?冰袋還是干冰?
凍存樣品都需要用干冰寄送,詳見采樣及寄送指南。如遇特殊情況,請咨詢我司。
病毒組樣本在進行去宿主的實驗時會損失胞內病毒嗎?
不會?;驇驮谌ニ拗鞲患《镜倪^程中會裂解宿主細胞釋放病毒,但不會破壞病毒顆粒的蛋白結構,因而不會損失已經包裝好的胞內病毒。